剧情承接《铁甲狂猴之亡命雷霆》，雷霆击败力霸与铁刹之后，苍穹又派出了更为致命的博士与银狐来追杀雷霆，雷霆逐个击破。最终雷霆重新拾起铁甲狂猴的正义使命，与苍穹展开了最终大战。

末日世界，地球一片荒芜。杀手雷霆叛变了自己所在的邪恶组织“天狼舟”，决定为正义而战。他救下为给老大苍穹换心脏的少女小洁等四人逃离天狼舟。苍穹派出力霸、铁刹军团来到沙漠中一所废弃的钢铁城追杀雷霆，一场猎