为军方研究生化武器的安布雷拉公司在浣熊市地下设有巨大的研究中心——蜂巢，由于一次意外事故导致可通过空气传播的生化武器泄露，负责蜂巢安保的电脑系统“红色女王”启动应急措施，却导致数百名工作人员罹难……四

一天晚上，女博士卡特琳娜在家中遭到一伙蒙面歹徒的袭击，当她侥幸逃脱后，发现丈夫和孩子已经遇害。卡特琳娜从事人类细胞克隆技术的研究，反对把这项研究用于商业目的。她的态度惹恼了一些想进行非法交易的大公司，

一场突如其来的鼠疫在德国科隆降临。一时之间，街道、下水道、家里、垃圾堆，到处都堆满了老鼠。一例例被感染的病人相继死去。一批批的人被强硬隔离起来，恐惧与慌乱随着空气一起蔓延开来，整个城市被死神的阴影笼罩